Mega Man Zero

Mega Man X serisinde Sigma'nın yenilgisinden bir yüzyıldan fazla bir süre sonra, barışı korumak için Neo Arcadia adında yeni bir hükümet kuruldu. Neo Arcadia liderleri, reploidleri haksız yere Maverick olarak damgalayarak onları avlamaya başladı. Şimdi reploidlerin tek umudu, efsanevi bir reploid: Kızıl Kahraman olarak bilinen Zero.

Reploidlerin haksız yere suçlanmasını hisseden Ciel, Neo Arcadia'dan kaçar ve Neo Arcadia'ya karşı bir Direniş oluşturur. Oyun, Ciel ve küçük bir grup direniş askerinin Pantheonlar ve Golemlar tarafından avlanmasıyla başlar. Bazı direniş askerleri geride kalır, ama ilerleyişlerini durduramazlar. Takip edilen Ciel, devasa bir kapıya ulaşır. Cyber-elf'i Passy der ki: "Buradan güçlü bir enerji hissediyorum. Burası olmalı." Sonra askerler kapıyı havaya uçurur ve Ciel, Passy ile Milan odaya girer, ortasında 100 yıldır etkisiz olan Zero'nun cansız bedeniyle.

Milan ona dokunmaya çalışır, ama Zero'yu koruyan enerji kalkanı tarafından geri itilir. Kalkanı nasıl aşacaklarını çözmeye çalışırken Pantheonlar kapıda belirir. Milan, Ciel'e kaçmasını emreder ve Pantheonlardan birinin vurmasıyla ölür. Passy, Ciel'e der ki: "Gücümü kullanmalısın. Başka seçeneğin yok." Ciel, yaklaşan Pantheonlar arasında düşünür ve üzüntüyle kabul eder. Passy'nin fedaî, enerji kalkanını yıkar ve Zero'yu diriltir. Zero, Ciel'e yardım eder ve masum reploidlerin emekli edilmesinden sorumlu olanın, aslında bir kopya olmasına rağmen Mega Man X olduğunu öğrenir.