Nicktoons Unite!

Oyun, SpongeBob'un Plankton'un devasa vakum makineleriyle Bikini Bottom'u ele geçirdiğini keşfetmesiyle başlıyor. SpongeBob'un evinin arkasındaki bir portaldan çıkan Goddard, ona Jimmy Neutron'dan bir mesaj gösterir. Goddard'ı portaldan takip eden SpongeBob, Jimmy Neutron, Timmy Turner ve Danny Phantom ile Jimmy'nin laboratuvarında tanışır. Jimmy, SpongeBob'u susuz kalmasın diye kendi kendini yenileyen nemle kaplar. Jimmy, son icadı olan Evren Portal Makinesi'nin Profesör Calamitous tarafından kopyalandığını ve Plankton, Vlad Plasmius ve Denzel Crocker ile bir Sendika kurduğunu açıklar; onlar zaten dünyalarından enerji çalmaktadırlar.

Kahramanlar Casper High'a ışınlanmaya çalışırlar, ancak Vlad'in şatosuna varırlar. Orada Vlad, Hayalet Bölgesi'nden enerji çekmek için hayalet portalını kullandığını ve Danny'nin ebeveynlerini kaçırdığını ortaya koyar. Vlad, grubu bayıltır ve onları Hayalet Bölgesi Hapishanesi'ne hapsettirir. Kutu Hayaleti ile arkadaş olan kahramanlar, Walker'ı yenerek kaçarlar. Danny, kahramanları Fenton Works hayalet portalına götürür ve Sam Manson ile Tucker Foley ile tanışırlar. Şatoya döndüklerinde, portalın jeneratörlerini yok ederler. Danny, babasını ele geçirir ve Hayalet Eldivenlerini kullanarak Vlad'e saldırır, ancak Vlad kaçar. Kahramanlar daha sonra Bikini Bottom'a giderler ve Jimmy'nin su altında nefes almaları için hava sakızını kullanırlar. Sandy Cheeks onları Jellyfish Fields'a Patrick Star ile buluşmak için gönderir, ancak bir jöle toplayıcıya çekilir. Toplayıcıları yok ettikten sonra, kahramanlar Uçan Hollandalı'nın gemisinde bulurlar. Danny, eski mürettebatını geri getirme karşılığında onları serbest bırakması için Uçan Hollandalı'yı ikna eder. Chum Bucket'a vardıklarında, Patrick ve jöleleri kurtarırlar. Çatıda, Mr. Krabs'i kurtarmak için devasa bir robotik yengeci kullanan Plankton ile savaşırlar ve kötülerin bir Kıyamet Makinesi'ni güçlendirmek için enerji çektiğini öğrenirler.

Dimmsdale'de kahramanlar, Crocker'ın altın kalesinin gücünü kapatırlar. Daha sonra Peri Dünyası'na giderler, burada Jorgen von Strangle ile karşılaşırlar, perileri kurtarırlar ve Crocker'ı The Big Wand'da bir exosuit kullanarak yenerler. Grubun daha sonra Jimmy'nin laboratuvarına dönerler ve Cindy Vortex ile tanışırlar. Jimmy daha sonra Calamitous'un Goddard'a casusluk için bir pire-bot yerleştirdiğini fark eder. Kahramanlar, Jimmy'nin küçültme ışınını kullanarak Goddard'a girerler, pire-bot'u yok ederler ve onu hackleyerek Calamitous'un sığınağını bulurlar. Kahramanlar Sendika'yı yenerler ve SpongeBob Kıyamet Makinesi'ni söker. Calamitous hapiste olduğunda, Jimmy her kahramana bir Neutronic Recaller verir ve yollarını ayırırlar.