Metal Gear Solid: Portable Ops

Portable Ops, Metal Gear Solid 3: Snake Eater'ın olaylarından altı yıl sonra, 1970 yılında geçiyor. Eski birimi FOX'un Güney Amerika üssünde bir isyan başlattığında, Naked Snake (David Hayter/Akio Ōtsuka) onlarla savaşmak zorunda kalıyor. Savaşı sırasında Roy Campbell (David Agranov/Toshio Furukawa) ile tanışıyor, olayı araştırmak için gönderilen Yeşil Bereliler ekibinin hayatta kalan üyesi. Snake'in eski takım arkadaşları, yani komutanı Albay Zero (Jim Piddock/Banjō Ginga), Para-Medic (Heather Halley/Houko Kuwashima) ve Sigint (James C. Mathis III/Keiji Fujiwara), Snake ile birlikte ihanet suçlamasıyla destek ekibi olarak geri dönüyorlar.

Ana düşman, FOX biriminin şu anki komutanı Gene'dir (Steven Blum/Norio Wakamoto), kendi askeri ulusunu kurmak isteyen The Boss'un kalıbına göre yapay olarak mükemmel bir komutan yaratmayı amaçlayan Halef Projesi'nin ürünüdür. Sorgulama tekniklerinde uzman olan Yüzbaşı Cunningham (Noah Nelson/Daisuke Gōri) tarafından yardım edilmektedir. (daha sonra CIA'nın itibarını zedelemeye çalışan Pentagon'un çift ajanı olduğu ortaya çıkar) Gene ayrıca, Kyshtym felaketi sırasında nükleer döküntüye maruz kalmanın sonucu olarak olağanüstü zihinsel yeteneklere sahip olduğu düşünülen Elisa (Tara Strong/Saori Goto) adında bir öğrencisi vardır. Elisa, kişilik bölünmesi bozukluğundan muzdariptir ve "Ursula" adında zihinsel yetenekleri daha güçlü olan bir ikinci kişiliğe sahiptir. "Ursula" olarak FOX üyesi olarak çalışırken, "Elisa" kişiliği Snake için bir bilgiçtir ve Null'un hemşiresidir. Snake, Elisa ile tanışır ve başlangıçta ona ve Ursula'ya ikiz kız kardeşler olduklarını söyler, ancak daha sonra gerçeği öğrenir. Snake'le daha önce ilişkili iki FOX üyesi, mükemmel asker olarak eğitilmiş genç bir suikastçı olan Null (Larc Spies/Jun Fukuyama) ve Vietnam Savaşı sırasında öldü sanılan Snake'in eski savaş arkadaşı Python'u (Dwight Schultz/Yusaku Yara) içerir.

Diğer karakterler arasında, ICBMG'nin varlığını ortaya çıkaran ve Snake ile iletişime geçen bir bilgiç olan Ghost (Brian Cummings/Naoki Tatsuta), Gene'i arkadan destekleyen eski bir Spetsnaz Binbaşısı olan Ocelot (Josh Keaton/Takumi Yamazaki), Snake Eater'da Snake'e yardım eden PLA casusu EVA (Vanessa Marshall/Misa Watanabe) ve GRU Binbaşısı Raikov (Charlie Schlatter/Kenyu Horiuchi) bulunmaktadır. Metal Gear Acid ve Metal Gear Acid 2'nin kahramanları olan Teliko Friedman (Kari Wahlgren/Yūko Nagashima) ve Venus (Kathryn Fiore/Rika Komatsu), belirli yan görevleri tamamlayarak veya ilgili oyunların kayıt verileriyle ikinci oynatma başlatarak oyuncunun takımına eklenebilir.