GoldenEye: Rogue Agent

Oyunun başında, M (MI6'nın başı) tarafından yapılan bir kayıtta şunlar belirtilir: "Üç yıl önce, görev sırasında Dr. No ile çatışmada ağır yaralandı ve sağ gözünü kullanma yetisini kaybetti. İntikam yemini ederek sık sık şiddet ve acımasızlığa başvurduğu için artık MI6'ya uygun değildir." Bu hesaba göre, Dr. No görev sırasında ajanın sağ gözüne ateş etmiştir.

Ajanın sağ gözünü kaybettiği olaydan üç yıl sonra, bir holografik simülasyonla değerlendirilir. Bu simülasyonda 007 ile eşleştirilir ve Auric Goldfinger'ı, bir suç örgütünün üyesi olan, Fort Knox'un içinde bir nükleer çantayı patlatmaktan alıkoymaya çalışırlar. Testten geçemez ve 007'nin "ölümünden" doğrudan sorumlu tutulur. "Düşüncesiz acımasızlık" suçlamasıyla MI6'dan ihraç edilir. Merkezden ayrılırken, Goldfinger'ın örgütüne katılma teklifini okur.

Ajan, Goldfinger'ın teklifini kabul eder ve onun adamı olarak işe alınır. Auric Enterprises'ta Goldfinger ile tanışır. Burada bilim adamları, organik maddeyi neredeyse atomik seviyede parçalayabilen bir enerji salınımı yayan OMEN (Organik Kütle Enerji Nötralizatörü) adlı bir silah geliştirmişlerdir. Dr. No'yu ortadan kaldırmak için, ajan Francisco Scaramanga tarafından yapılan altın rengindeki kibernetik bir göz alır. Scaramanga, göz için güncellemeler sağlar ve MRI görüşü ile başlar. Hong Kong'da, GoldenEye bir keskin nişancı tüfeği almalı ve EM hack özelliği ile Dr. No'yu öldürmelidir. Midas Kasinosu'nda, GoldenEye kasaya ulaşmalı (çok oyunculu modda bulunabilir) ve manyetik kutupluluk kalkanı ile OMEN'i korumalıdır. Hoover Barajı'nda, GoldenEye barajı yok etmeli ve Xenia Onatopp'u öldürmelidir. GoldenEye ayrıca Oddjob'u, bilinmeyen nedenlerle GoldenEye'i ihanet edip saldırdıktan sonra, Hoover Barajı'nın içindeki bir çukura atar. The Octopus'ta, GoldenEye kendi altın gözünden oluşturulan bir kuvvet alanının yardımıyla Dr. No'nun üssü olan Crab Key'e giden yol koordinatlarını indirmelidir. Sonunda Crab Key'e gönderilir ve burada Dr. No ile yüzleşir. Kavgada, GoldenEye mekanik gözünü kullanarak adanın nükleer reaktörünü sabote eder ve Dr. No'yu elektrik çarpmasına uğratır. Dr. No'nun ölümü üzerine, Goldfinger GoldenEye'a bağlanır ve ona, savunma ağını devre dışı bırakacak bir programı etkinleştirmesini söyler. Goldfinger, Sığınağı ele geçirme niyetinde olduğunu açıklar ve GoldenEye'ı yaklaşmakta olan nükleer erimeye terk eder. Ancak GoldenEye, reaktör patlamadan önce Dr. No'nun osprey'inde kaçmayı başarır ve ada büyük bir patlamayla yok olur.

GoldenEye, Goldfinger ile yüzleşmek için Sığınağa döner. Pussy Galore, GoldenEye ile buluşur ve ona, Goldfinger'ın OMEN'i kullanarak Sığınağın çoğunun muhafızlarını ortadan kaldırdığını ve kontrolü ele geçirdiğini söyler. Scaramanga, mekanik göze bir bilgisayar virüsü sağlar, bu virüsü OMEN'i aşırı yüklemek için kullanabilir. GoldenEye, Sığınağın içinden ilerler ve virüsü yerleştirir, sonunda Goldfinger ve OMEN'in olduğu alana ulaşır. Goldfinger, GoldenEye'ı oksijensiz hale gelecek bir odada tuzaklar. Bilgisayar virüsü daha sonra OMEN'i etkinleştirir, bu da bir enerji patlamasıyla patlar ve Goldfinger ile adamlarını öldürür. GoldenEye ve Galore, Galore'un helikopteriyle Sığınağı terk ederler ve Scaramanga ile Number One (Ernst Stavro Blofeld), GoldenEye'ın yaptıklarını gözlemlemeye ve sonra hareket etmeye karar verirler.